山東大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院導(dǎo)師--薛付忠簡(jiǎn)介

研究方向1：空間流行病學(xué)與空間遺傳學(xué)理論方法及其應(yīng)用研究
近年來(lái)，隨著地理信息系統(tǒng) (GIS) 的迅速發(fā)展 , 地理流行病學(xué)和基因地理學(xué)與 GIS 和空間統(tǒng)計(jì)學(xué)等學(xué)科有機(jī)結(jié)合，開(kāi)始向更高層次的空間流行病學(xué)和空間遺傳學(xué)發(fā)展；國(guó)內(nèi)外在此領(lǐng)域的研究尚處于起步階段。本課題組一直將“空間流行病學(xué)與空間遺傳學(xué)理論方法及其應(yīng)用”作為重要研究方向之一。
在空間流行病學(xué)理論與方法研究方面主要是在傳統(tǒng)地理流行病學(xué)基礎(chǔ)上，在GIS框架下，重點(diǎn)研究“疾病空間分布的概率生成模型，疾病空間分布狀態(tài)量化統(tǒng)計(jì)指標(biāo)，疾病空間估計(jì)方法，疾病空間分布趨勢(shì)面模型理論方法及其偏倚控制，疾病空間異質(zhì)模型及其流行病學(xué)含義，疾病地理界限識(shí)別及疾病地理區(qū)劃定量方法，流行病學(xué)標(biāo)點(diǎn)地圖統(tǒng)計(jì)推斷方法”等領(lǐng)域。在空間流行病學(xué)應(yīng)用研究方面，重點(diǎn)研究腎綜合征出血熱和結(jié)核病等重大傳染病的空間流行病學(xué)特征、時(shí)空傳播軌跡追蹤及其區(qū)域化預(yù)防控制措施的制定。
在空間遺傳學(xué)理論與方法研究方面主要是針對(duì)傳統(tǒng)基因地理學(xué)方法的不足，在GIS框架下，重點(diǎn)研究“基因頻率矩陣降維綜合的非線性多元分析方法和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析的Biplot模型，人類(lèi)群體遺傳空間結(jié)構(gòu)變異函數(shù)模型及其群體遺傳學(xué)參數(shù)，人類(lèi)群體遺傳空間結(jié)構(gòu)的地理遺傳梯度及地理界限識(shí)別，人群基因流動(dòng)空間軌跡統(tǒng)計(jì)推斷，人類(lèi)群體遺傳空間結(jié)構(gòu)成分的定量分解”等領(lǐng)域。在空間遺傳學(xué)應(yīng)用研究方面，重點(diǎn)研究“疾病易感基因多態(tài)性（HIV感染相關(guān)基因、HBV基因、ACE基因、細(xì)胞色素基因、HLA基因等）的空間遺傳學(xué)和空間流行病學(xué)特征及其應(yīng)用，中國(guó)HLA限制性多表位疫苗的理論免疫應(yīng)答率預(yù)測(cè)系統(tǒng)，基于細(xì)胞色素基因家族的中國(guó)藥物基因組學(xué)及區(qū)域化個(gè)性治療規(guī)劃，基于STR多態(tài)性的中國(guó)區(qū)域化法醫(yī)DNA參考數(shù)據(jù)庫(kù)空間布局，基于全基因組SNP標(biāo)記的中國(guó)漢族人群空間遺傳結(jié)構(gòu)界限識(shí)別及其復(fù)雜疾病基因定位的空間病例對(duì)照研究設(shè)計(jì)，基于Y染色體、mtDNA，HLA、STR，SNP等遺傳標(biāo)記的中國(guó)南北人群遺傳結(jié)構(gòu)及其地理界限識(shí)別”等領(lǐng)域。
在該研究方向上，主持完成了“基因空間異質(zhì)性理論與定量分析方法的研究 (30170527 ) 、地理流行病學(xué)統(tǒng)計(jì)分析方法研究 (30070677 ) 和小地域生態(tài)環(huán)境內(nèi)腎綜合征出血熱的地理流行病學(xué)機(jī)制研究 (30471489) ” 三項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目；中國(guó)博士后基金項(xiàng)目“中國(guó)人群精細(xì)遺傳結(jié)構(gòu)的地理信息系統(tǒng)研究（2005038128）”，山東省醫(yī)藥衛(wèi)生十五攻關(guān)項(xiàng)目“山東省腎綜合癥出血熱綜合防治策略基礎(chǔ)研究”，山東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目“疾病空間分布的統(tǒng)計(jì)模型研究”，和艾滋病全球基金項(xiàng)目“山東艾滋病地理信息管理系統(tǒng)研究”及“山東省HIV－1感染相關(guān)基因多態(tài)性的地理流行病學(xué)研究與應(yīng)用”，以及奧運(yùn)會(huì)橫向合作項(xiàng)目“青島市食品安全時(shí)空預(yù)警系統(tǒng)”等多項(xiàng)課題。在國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)刊物發(fā)表論文30余篇；“中國(guó)HLA限制性多表位疫苗的理論免疫應(yīng)答率預(yù)測(cè)系統(tǒng)”獲國(guó)家專(zhuān)利，“空間流行病學(xué)技術(shù)方法研究及其在腎綜合征出血熱防控中的應(yīng)用”獲山東省科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)。
目前，在該研究方向上正在主持承擔(dān)“國(guó)家傳染病重大專(zhuān)項(xiàng)分題-耐多藥結(jié)核病流行因素的生態(tài)學(xué)研究（008ZX10003-007），國(guó)際合作項(xiàng)目“人類(lèi)遷徙圖計(jì)劃分題——東亞人群基因地理學(xué)研究”等課題。
研究方向2：復(fù)雜疾病基因定位試驗(yàn)設(shè)計(jì)及其統(tǒng)計(jì)分析方法研究
全球第一輪全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS） 高潮已初戰(zhàn)告捷，但其成果并不理想，與期望差距甚遠(yuǎn)；這與其試驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分析中某些關(guān)鍵問(wèn)題有關(guān)。試驗(yàn)設(shè)計(jì)上，多是單一疾?。ū硇停┎±龑?duì)照或病例隊(duì)列設(shè)計(jì)，缺乏針對(duì)疾病綜合潛在表型從其連續(xù)數(shù)量表型變異維度上闡明基因組變異與疾病發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸結(jié)局關(guān)系的縱向GWAS設(shè)計(jì)理念；數(shù)據(jù)分析上，多是單一SNP與單一性狀關(guān)聯(lián)分析，缺乏以整體基因（或非基因區(qū)域）為單位分析其與綜合潛在表型動(dòng)態(tài)關(guān)聯(lián)性的推斷方法。針對(duì)這些不足，近年來(lái)本課題組一直致力于“疾病綜合潛在表型的整體基因（whole gene-baed）和基因組區(qū)域化（Genome-wide region-based）關(guān)聯(lián)分析及其交互作用統(tǒng)計(jì)推斷方法”的研究，旨在為GWAS數(shù)據(jù)分析提供高效的新方法，提高其科學(xué)性和成果價(jià)值。
在該研究方向上，主持完成了“國(guó)家“863”項(xiàng)目‘復(fù)雜疾病基因定位研究的基因（環(huán)境）交互作用與遺傳交互網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建及其軟件系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)’（2007AA02Z312）’，國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目‘基因空間異質(zhì)性理論與定量分析方法研究’（30170527）”等課題。發(fā)表論文近10余篇，6篇被SCI收錄。
目前，在該研究方向上正在主持承擔(dān)“國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目‘基于核典型相關(guān)理論的整體基因之間交互作用統(tǒng)計(jì)推斷方法的研究（30871392）’、國(guó)家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目子分題‘中國(guó)人群基因組多態(tài)性的分子標(biāo)記及相關(guān)研究--中國(guó)（漢族）群體遺傳結(jié)構(gòu)及其對(duì)復(fù)雜疾病關(guān)聯(lián)分析影響的研究’（30890034-3）等課題。
研究方向3: 中藥藥性理論的統(tǒng)計(jì)分析方法研究
“中藥藥性基礎(chǔ)理論問(wèn)題”的核心是“中藥是一種客觀實(shí)在，藥性是其本質(zhì)屬性的主觀反映，功效是本質(zhì)屬性的客觀表現(xiàn)，藥性通過(guò)功效得以體現(xiàn)。藥性理論是性、味、歸經(jīng)等要素相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜理論。功效是體現(xiàn)藥性的核心，物質(zhì)成分是產(chǎn)生藥性的基礎(chǔ)，但某種物質(zhì)成分或某一藥效作用均不能表征中藥整體藥性。藥性-藥效-物質(zhì)間的關(guān)系是中藥藥性理論現(xiàn)代研究的關(guān)鍵。構(gòu)成中藥藥性理論的三個(gè)核心元素是藥性、物質(zhì)、功效”。為了驗(yàn)證這一核心理論，推動(dòng)中醫(yī)藥現(xiàn)代化進(jìn)程，近年來(lái)本教研室致力于研究“基于中藥化學(xué)圖譜的中藥藥性特征標(biāo)記統(tǒng)計(jì)模式識(shí)別模型，藥性與經(jīng)驗(yàn)要素、性狀要素、成分要素、功效要素關(guān)系的統(tǒng)計(jì)推斷方法，‘中藥藥性-藥效-物質(zhì)三元理論體系’的交互網(wǎng)絡(luò)模型”等重點(diǎn)攻關(guān)領(lǐng)域。
目前，在該研究方向上正在承擔(dān)國(guó)家“973”項(xiàng)目--“中藥藥性理論相關(guān)基礎(chǔ)問(wèn)題研究”（2007CB512600）的統(tǒng)計(jì)分析任務(wù)，并主持子課題子分題—中藥藥性理論的數(shù)據(jù)管理與分析平臺(tái)及其數(shù)學(xué)模型構(gòu)建（2007CB512601-5）。
研究方向4：醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)模式識(shí)別理論方法及其應(yīng)用研究  
近年來(lái)，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究被認(rèn)為是“驅(qū)動(dòng)臨床研究引擎的激發(fā)器”，已經(jīng)成為現(xiàn)代和未來(lái)醫(yī)學(xué)研究的主要模式和發(fā)展方向；轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究已經(jīng)成為國(guó)際上醫(yī)學(xué)研究的熱點(diǎn)問(wèn)題。其中，“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)臨床病例隨訪隊(duì)列示范平臺(tái)建設(shè)及其數(shù)據(jù)采集與統(tǒng)計(jì)分析方法”是當(dāng)前轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)領(lǐng)域亟待解決的關(guān)鍵領(lǐng)域之一。該領(lǐng)域涉及如何建立轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究成果的孵化、評(píng)價(jià)和推廣應(yīng)用示范平臺(tái)及其管理運(yùn)行機(jī)制，如何確定其推廣應(yīng)用的關(guān)鍵領(lǐng)域及其解決方案，如何建立科學(xué)的數(shù)據(jù)信息采集、管理和統(tǒng)計(jì)分析方法體系等一系關(guān)聯(lián)問(wèn)題。針對(duì)這些問(wèn)題，本課題組在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)方面的重點(diǎn)攻關(guān)領(lǐng)域包括：“重大疾病轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)臨床病例隨訪隊(duì)列示范平臺(tái)建設(shè)，基于生物標(biāo)記與臨床標(biāo)記的疾病計(jì)量診斷模型研究，疾病轉(zhuǎn)歸機(jī)制的網(wǎng)絡(luò)模型研究、疾病轉(zhuǎn)歸預(yù)警系統(tǒng)研究，臨床決策系統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)模型研究，個(gè)性化治療統(tǒng)計(jì)分析方法研究、疾病轉(zhuǎn)歸風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估指標(biāo)體系與統(tǒng)計(jì)模型研究，生物標(biāo)記臨床應(yīng)用價(jià)值評(píng)價(jià)，制定臨床路徑的統(tǒng)計(jì)分析方法研究”等。
目前，在該研究方向上，正在承擔(dān)“國(guó)家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目‘重大神經(jīng)精神系統(tǒng)疾病的預(yù)警指標(biāo)體系研究與預(yù)警模型開(kāi)發(fā)’（2008BAI52B03）”。
 

1986 年畢業(yè)于山東省淄博衛(wèi)生學(xué)校，同年分配至山東省平邑縣衛(wèi)生防疫站從事流行病學(xué)現(xiàn)場(chǎng)工作。1992 年畢業(yè)于原山東醫(yī)科大學(xué)預(yù)防醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)，1999 年獲山東大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)專(zhuān)業(yè)碩士學(xué)位，2005 年獲山東大學(xué)流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)專(zhuān)業(yè)博士學(xué)位，2005 年-2007 年在復(fù)旦大學(xué)現(xiàn)代人類(lèi)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成了統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)與群體遺傳學(xué)專(zhuān)業(yè)博士后研究，2009 年9 月-2010 年8 月在英國(guó)劍橋大學(xué)-MRC 流行病學(xué)研究所做訪問(wèn)學(xué)者，主要從事隊(duì)列研究GWAS 數(shù)據(jù)分析和建模的合作研究。

博士研究生每年招收計(jì)劃1-2名

Peng Q, Zhao J, Xue F*(通訊作者). PCA-based bootstrap confidence interval tests for gene-disease association involving multiple SNPs. BMC Genet. 2010 Jan 26;11(1):6.
Peng Q, Zhao J, Xue F*(通訊作者). A gene-based method for detecting gene-gene co-association in a case-control association study. Eur J Hum Genet. 2009 Dec 23. [Epub ahead of print]
Zheng Q, Shi Y, Yang Z, Xu X, Wang L, Xue F, Gu HF, Chen ZJ. Family-based association study of the MCF2L2 gene and polycystic ovary syndrome. Gynecol Obstet Invest. 2009;68(3):171-3. Epub 2009 Jul 31.
Xue F, Wang Y, Xu S, Zhang F, Wen B, Wu X, Lu M, Deka R, Qian J, Jin L. A Spatial Analysis of Genetic Structure of Human Populations in China Reveals Distinct Difference between Maternal and Paternal Lineages. Eur J Hum Genet. 2008 Jan
23 [Epub ahead of print]
Xue F, Wang J, Hu P, Ma D, Liu J, Li G, Zhang L, Wu M, Sun G, Hou H. Identification of spatial genetic boundaries using
a multifractal model in human population genetics. Hum Biol. 2005; 77(5):577-617
Xue FZ, Wang JZ, Ma DX,Li GR, Hu P. Spatial genetic structure of two HIV-I-resistant polymorphisms (CCR2-64 I and
SDF1-3'A) alleles in population of Shandong Province, China. Biomed Environ Sci. Aug 2005(18):241-253
Xue FZ, Wang JZ, Hu P, Li GR. The “Kriging” model of spatial genetic structure in human population genetics.Yi Chuan Xue Bao(遺傳學(xué)報(bào)). Mar 2005(32):219-233
XUE Fu-zhong, WANG Jie-zhen, HU Ping, GUO Yi-shou, LI Guo-rong. Forecasting system on spatial coverage of cumulative phenotypic frequency of HLA class Ⅰ for designing HLA-based vaccines in China. 免疫學(xué)雜志.
2005(21):136-141
彭倩倩，薛付忠*(通信作者）.permutation-PCA 方法在病例對(duì)照關(guān)聯(lián)分析中不同遺傳模型下的表現(xiàn). 山東大學(xué)自 然科學(xué)學(xué)報(bào)（醫(yī)學(xué)版），2009，03（47）：94-97
張茜，薛付忠*（通信作者）.類(lèi)群體遺傳空間結(jié)構(gòu)分析的典型趨勢(shì)面模型. 山東大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào)（醫(yī)學(xué)版）2009；第2 期
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類(lèi)群體遺傳結(jié)構(gòu)雙標(biāo)圖模型及其應(yīng)用. 科技導(dǎo)報(bào). 2006(24):16-24
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類(lèi)群體遺傳空間結(jié)構(gòu)對(duì)應(yīng)分析中的“蹄型效應(yīng)”及其校正方法. 中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì).2006(23):194-198
薛付忠, 王潔貞, 張娜, 胡平. 人類(lèi)群體遺傳結(jié)構(gòu)的圖論主坐標(biāo)分析方法. 山東大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2006(44):109-113
薛付忠, 王潔貞, 胡平. 中國(guó)人群胰島素依賴(lài)性糖尿病HLA-DQ 基因多態(tài)性的Meta 分析. 中華內(nèi)分泌與代謝雜 志. 2005(21):39-42
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平, 王振光. 人類(lèi)群體遺傳結(jié)構(gòu)的圖論主成分分析方法. 中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì). 2006(23):194-198
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類(lèi)群體遺傳空間結(jié)構(gòu)對(duì)應(yīng)分析中的“蹄型效應(yīng)”及其遺傳學(xué)解釋. 遺傳. 2005(27):972-979
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類(lèi)群體遺傳空間結(jié)構(gòu)的均值化協(xié)方差陣主成分分析. 人類(lèi)學(xué)學(xué)報(bào). 2005(24):221-231
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平, 吳學(xué)森. 等位基因多態(tài)性群體遺傳結(jié)構(gòu)的多元非線性分析方法. 遺傳學(xué)報(bào).2004(31):202-211
薛付忠, 王潔貞, 胡平. 中國(guó)人群胰島素依賴(lài)性糖尿病HLA-DR 基因多態(tài)性的Meta 分析. 山東大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版).2004(42):534-539
衛(wèi)生部研究生規(guī)劃教材《統(tǒng)計(jì)分析在醫(yī)學(xué)課題中的應(yīng)用》 人民衛(wèi)生出版社，編委
研究生規(guī)劃教材《流行病學(xué)研究方法與應(yīng)用(第二版)》科學(xué)出版社，編委
教育部本科生規(guī)劃教材《醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)（第2版）》高等教育出版社，編委
衛(wèi)生部臨床八年制規(guī)劃教材《醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)》，人民衛(wèi)生出版社，編委
 

近3年主持的科研項(xiàng)目
1.國(guó)家“973”項(xiàng)目分題，“中藥藥性理論相關(guān)基礎(chǔ)問(wèn)題研究” （2007CB512600）（任整個(gè)“973”項(xiàng)目統(tǒng)計(jì)分析組組長(zhǎng)）,并主持子課題子分題—中藥藥性理論的數(shù)據(jù)管理與分析平臺(tái)及其數(shù)學(xué)模型構(gòu)建（2007CB512601-5）），（總經(jīng)費(fèi)50萬(wàn)元）。
2.國(guó)家自然基金項(xiàng)目，基于核典型相關(guān)理論的整體基因之間交互作用統(tǒng)計(jì)推斷方法的研究（30871392），經(jīng)費(fèi)31萬(wàn)元。
3.國(guó)家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目分題子課題，中國(guó)人群基因組多態(tài)性的分子標(biāo)記及相關(guān)研究（30890034）；負(fù)責(zé)分題——中國(guó)（漢族）群體遺傳結(jié)構(gòu)及其對(duì)復(fù)雜疾病關(guān)聯(lián)分析影響的研究（30890034-3），經(jīng)費(fèi) 20萬(wàn)元
4. 國(guó)際合作項(xiàng)目，人類(lèi)遷徙圖計(jì)劃分題——東亞人群基因地理學(xué)研究，總經(jīng)費(fèi)30萬(wàn)元
5.山東艾滋病地理信息管理系統(tǒng)研究（GS-2007-04），艾滋病全球基金項(xiàng)目，經(jīng)費(fèi)2萬(wàn)元；
6.國(guó)家傳染病重大專(zhuān)項(xiàng)分題-耐多藥結(jié)核病流行因素的生態(tài)學(xué)研究，經(jīng)費(fèi)31.5萬(wàn)元
7.復(fù)雜疾病基因定位研究的基因（環(huán)境）交互作用與遺傳交互網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建及其軟件系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)（2007AA02Z312），經(jīng)費(fèi)104萬(wàn)元；
8.“重大神經(jīng)精神系統(tǒng)疾病的預(yù)警指標(biāo)體系研究與預(yù)警模型開(kāi)發(fā)”（2008BAI52B03）
 

(1)空間流行病學(xué)技術(shù)方法研究及其在腎綜合征出血熱防控中的應(yīng)用 省科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)
（2）中國(guó)HLA限制性多表位疫苗的理論免疫應(yīng)答率預(yù)測(cè)系統(tǒng)，國(guó)家專(zhuān)利

《醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)》，《多元統(tǒng)計(jì)分析與SAS應(yīng)用》，《復(fù)雜疾病基因定位試驗(yàn)設(shè)計(jì)與統(tǒng)計(jì)分析方法》

目前共培養(yǎng)碩士研究生十余名，2011年開(kāi)始招收博士研究生。

電話：0531-88380280， 13906405997

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（1）疾病預(yù)防控制；（2)醫(yī)院臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)與統(tǒng)計(jì)分析
（3）高等醫(yī)藥院校：（4）生物醫(yī)藥公司